在北京生命科学研究所的一间实验室内，资深研究员黄牛和团队成员正紧盯着屏幕，一组刚刚运行完的计算结果赫然呈现。依托“神威·太湖之光”超级计算机的磅礴算力，他们已经在海量虚拟筛选的结果中，通过实验验证，成功找到了六把可能解决新药研发难题的候选“钥匙”——分别针对六种重要疾病靶点的潜在药物先导化合物。

这是一场关于速度与成本的技术变革。过去，新药研发中的超大规模虚拟筛选任务，计算费用高达千万元，让无数科研人员和中小团队望而却步。而现在，这一切正在被改写。

神威·太湖之光超级计算机。人民网记者 常雨薇摄

“在SWDOCKP2诞生之前，这事我们想都不敢想。”黄牛感慨道。

在过去将近一年时间里，他的团队完成了一项堪称壮举的任务：将约150万个化合物，针对约6000个人类疾病靶点蛋白质，全部进行了计算筛选，总计算量高达250亿次分子对接模拟。

黄牛打了个形象的比方：如果把小分子化合物比作钥匙，蛋白靶点就是锁芯。传统的新药研发模式，如同在茫茫大海中一把一把地试钥匙；而有了超算加持的虚拟筛选技术，就像给科研人员加装了一套“智能导航”，帮助他们快速锁定目标。

“这就像我们领域的DeepSeek时刻。”谈及成果，黄牛很是兴奋，“对于患者而言，创新药物研究是从0到1的跨越。那些过去无药可医的疾病，有了研发新药的起点。”

然而，一次超大规模虚拟筛选往往需调用大规模高性能计算集群连续运行数周甚至数月，成本估算高达数千万元。“当化学库膨胀到百亿级时，就算是头部药企也难以承担算力成本。”黄牛说。

转机出现在2020年初，一次线上学术交流让黄牛与国家超级计算无锡中心结了缘。

国家超级计算无锡中心。国家超级计算无锡中心供图

彼时，国家超级计算无锡中心依托“神威·太湖之光”，正思考如何将大国重器的巅峰算力转化为科研生产力。

具有跨学科背景的沈成博士成为新药发现平台负责人，他协调来自清华大学、山东大学、北京生命科学研究所等多方力量组建跨学科联合团队。经过持续技术攻关，联合团队研发出了高效超大规模药物虚拟筛选软件，将经典的分子对接软件移植到新一代大国重器“神威·太湖之光”超级计算机上，并进行了深度优化。

2022年，首版软件SWDOCK实现每日700亿配体筛选。2025年，新一代性能可移植虚拟筛选框架SWDOCKP2正式亮相，可调度3900万个计算核心，实现每日1.9万亿次对接。“若以银河系约4000亿颗恒星为参照，单日筛选量相当于五个银河系的恒星总和。”沈成说。

这场技术突破的影响已经开始显现。在北京、上海、苏州，多家新药研发企业借助这一平台筛选出了一批极具潜力的小分子苗头化合物；在北京生命科学研究所，多个全新靶点完成概念性验证，并发现了先导化合物；复旦大学、中国科学院某研究所等科研机构也正基于该平台设计新型抑制剂。

这场必将影响深远的技术变革，发生在太湖之滨的滨湖区，绝非偶然。这里集聚了无锡全市近90%的科教资源，仅省部属科研院所就有12家。江南计算技术研究所、中国船舶科学研究中心等顶尖机构坐落其间。江南大学等高校则源源不断地输送着青年人才。滨湖秀美的山水，也为科研人员提供了潜心钻研的静谧空间。

滨湖区城市风光。滨湖区委宣传部供图

“这里既是‘神威’系列超算的诞生地之一，也拥有最懂超算、最需要算力支持的专家团队和应用场景。”国家超级计算无锡中心副主任刘钊介绍。

过去十年，“神威·太湖之光”多次荣获国际高性能计算应用领域“皇冠上最璀璨的明珠”——“戈登·贝尔奖”，该中心还组建起了一支近200人的研发团队。这支队伍让超算从一套固定的硬件装置，变成了能持续优化迭代、能对接千行百业需求的“活平台”。

在航空航天领域，民用飞机多学科联合设计优化软件平台攻克技术瓶颈，百万核并行效率达89.65%；在气象预报领域，蠡云气象大模型融合前沿AI架构，台风预报能力已达到国际水平；在低空经济领域，智能低空数字孪生系统构建全域低空数字底座，可实现空域态势实时感知、智能分析。

今年6月，中心成立十周年之际，“国家超级计算无锡中心智能计算应用服务平台”正式启动。它能够让企业和研发机构便捷地调用算力与算法，为先进制造、新药研发、气候气象等行业提供“开箱即用”的智能计算支撑。

刘钊描绘了一个更宏大的蓝图：“未来，我们希望实现科研人员只需提出需求和问题，系统就能自动调度算力、运行软件、评估结果。”在他看来，超级计算机正在从一个冰冷的“工具”，进化为一个懂行的“助手”。

目前，无锡超算正全力推进“超智融合”战略，致力于让传统高性能算力和新型智能算力融合汇聚，像自来水和电力一样，拧开阀门、按下开关就能顺畅地流入产业的每一个角落。

从我国首个巨型计算机“银河”，到如今的“神威·太湖之光”，新时代科技人正走在自己的长征路上。而这，只是一个开始。当算力真正成为基础设施，当每一次虚拟筛选都在为新药研发按下加速键，中国算力的征途上，还会有更多破冰之举。